（一）重建意願不一致
財團法人九二一震災重建基金會運用捐款推出了許多重建方案來協助社區進行重建，其中築巢專案之臨門方案，是促使集合住宅及社區完成更新重建的主要關鍵。從通過臨門方案審查的社區案例來看，社區取得建照進入實質重建階段後，有部分住戶拒簽合約，或簽了合約卻又退出（有部分係基於經濟因素，有部分質疑重建經費負擔或更新會之運作，也有部分自始存著投資心態，在無法如願出售下，即表明退出重建或不清償融資），對於已簽訂臨門合約後，陳情退出重建或表明不清償融資者，基金會請社區更新會依權責及內政部頒布之「九二一災後更新重建權利變換產權移轉作業手冊」規定辦理。
（二）逾期未簽約而撤銷協助
部分社區因內部問題，遲遲未能完成臨門合約簽約事宜，如少數社區有工程發包與招標作業問題，或未能於期限內簽定有效之營造合約並進行首次款項動撥，而遭基金會將原匡列之協助價款予以撤銷之情形，或重建工程執行階段，出現工程品質爭議或勘驗等方面之問題，協助價款因而遭到凍結，工程也因此停工。
（三）出現住戶失聯情形
在進行還款意願調查時，也有社區住戶出現失聯的情形，一連串的事件，不僅使臨門方案賴以維繫的基礎受到衝擊，對於積極推動臨門方案的基金會而言，其對住戶是否會依約還款的信心也因此改變。面對這些層出不窮的變數，基金會雖然調整了推動臨門方案的步伐，但仍然堅持再透過道德勸說，期勉更新會「整合過程必紮實」、「資訊傳遞務必清楚」、「工程發包務必公開」、「工程監督務必確實」，也拜託所有協力單位都能以敬畏天地的態度，做好每一階段的工作，共同寫下這段歷史。
