（一）重建組織未整合
九二一震災前，雖然多數社區都有依據公寓大廈管理條例成立社區管理委員會，並選出主任委員；震災後，為推動重建工作成立了社區重建推動委員會，為進行更新重建成立了都市更新會，但有部分社區在重建初期，因震前與震後社區組織運作之角色與地位不明確而意見分歧，甚至出現原組織之代表人惡意杯葛抗衡與競相爭取重建資源（如行政事務補助費）或重建事務難以統籌研商與分工合作進行之情形。另有關公共基金運用部分，按建築物如經震災全倒並經拆除滅失，其區分所有權已不存在，故公共基金不宜由該社區成立之都市更新會、社區重建推動委員會運用，應由土地持分所有權人或地上權人所共有，並依民法合意為之，而重建組織之運作，則應加強聯繫並釐清權責，避免曖昧模糊的關係而造成功能不彰。
（二）會議程序未嫻熟
社區重建組織之成員，係以原區分所有權人為基礎，然社區為討論重建等公共事務而進行開會之相關作業程序未必熟稔，部分社區也未遵照都市更新團體設立管理及解散辦法、更新會章程與議事規則等規定進行，尤其在會議通知、委任出席及議題討論與表決時，會因程序瑕疵而出現爭議，而令人質疑公平性與代表性，理監事聯席會議討論過程與結果，也曾出現以訛傳訛之情形，導致社區派系分立，或因重建意見分歧而立場不同，已直接或間接地影響人際關係與重建事務之推展。
（三）交接事務未釐清
另一方面，帳務未清楚公布也是會務運作問題之一，一旦有新舊任理監事交接而本身又是爭議人物時，即可能出現交接帳目不清或丟三落四之情形，甚至衍生訴訟問題；交接生效日如又未經雙方確認，一旦發生訴訟與糾紛情事，責任恐難以釐清，並衍生困擾。此外，亦有理事長因為不清楚法人團體之代表人意義，未經理監事或會員授權，即以個人名義和營造廠商或規劃單位私自訂約，遭其他會員反對或陳情異議，導致紛爭不斷，影響重建。
為瞭解社區更新會是否依都市更新條例及其相關子法之規定，執行核定之計畫內容，並避免更新會業務廢弛而影響重建工作，臺中縣政府基於輔導與監督管理之原則，宜主動提醒各社區更新會，理事長與理事及監事之任期如屆滿，應即辦理改選事宜，並於期限內完成交接及相關資料（如帳冊、會議紀錄、函文、印鑑、章程、立案證書等）移交事宜，並副知相關單位，以杜爭議。
